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宏基因组测序

宏基因组测序

一、服务介绍

宏基因组学研究不要求对每个微生物进行分离纯化培养,而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过宏基因组测序,能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系,极大地扩展了微生物学研究范围。环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rDNA高变区/ITS 的PCR扩增产物进行高通量测序,分析该环境下微生物群落的多样性和分布规律

二、操作流程

1 基因组DNA提取

2 DNA随机打断

3 加测序街头、构建文库

4 上机测序

5 序列拼接

6 生物信息学分析

三、生物信息分析

1. 物种鉴定

2. 多样性统计学分析

3. 宏基因组拼接

4. 功能分析

5. 微生物群落结构及功能

四、 样品要求
1)样品类型:人体微生物的基因组DNA(双链DNA序列)。

2)样品的量:构建小片段文库,DNA样品总量不低于5µg。

3)样品质量: OD260/280值应在1.8~2.0 之间;样品的主带应在23kb以上,保证基因组无降解。

5)样品浓度:样品的浓度越高越好,最低不应低于50ng/µl。

6)送样要求:寄送样品最好保持低温环境,最好的方法是冻干邮寄,其次是溶于TE,当然也可以溶于双蒸水,样品必须注明溶剂成分。

五、质量承诺
提供可靠数据和分析结果。